食品经营许可证办理窗口办理和网上办理所需的基本材料大致相同，但在一些细节和形式要求上可能存在差异：
相同材料3：
申请表：无论是窗口还是网上办理，都需要填写食品经营许可申请书，申请书上要包含法定代表人（负责人）的相关信息等。
主体资格证明：都需要提供营业执照或者其他主体资格证明文件的复印件，以证明企业或个人的合法经营主体身份。
人员健康证明：从事直接入口食品经营、散装食品经营和餐饮服务的，无论是窗口还是网上申请，都需提交食品从业人员的健康体检证明。
制度文件：要提供食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录、食品安全事故处置等保证食品安全的规章制度文本247。
授权委托书（若委托办理）：申请人委托他人办理食品经营许可申请的，都需要提交授权委托书以及代理人的身份证明文件3。
不同之处：
网络平台证明及网店截图（针对网络经营）：如果是通过网络平台从事食品经营活动，网上办理时可能需要提供网络平台的证明以及网店的截图等材料，以证明经营的合法性和真实性，但窗口办理时不一定需要在申请阶段就提供。
房屋质量安全鉴定报告（针对特定经营场所）：一些地区对于利用经营性自建房作为经营场所的，网上申请时可能要求上传经营性自建房房屋质量安全鉴定报告，而窗口办理时可能会后续根据实际情况要求提供。
窗口办理：一般要求提交纸质材料，所有的复印件需注明 “与原件一致”，并签署姓名和日期3。例如营业执照复印件、身份证复印件等都要按此要求准备。如果有图纸类材料，如经营场所的平面图等，可能需要打印在标准纸张上，并清晰标注相关信息。
网上办理：需要将材料扫描或拍照后上传电子版，图片或文档的格式、大小等可能要符合办理系统的要求。比如有的地方要求上传的图片为JPEG 或 PDF 格式，且文件大小不能超过一定限制。
材料形式：
额外材料要求（部分地区网上办理）6：
