微生物菌肥使用次数的控制
前面说过微生物菌肥的主要目的就是增加土壤有益菌含量，提高土壤的活力，提高养分的利用率，使用微生物菌肥后会使土壤有益菌明显增加，随着时间的迁移，有益菌会被逐渐消耗殆尽，土壤有益菌数量会逐渐减少，恢复至施用微生物菌肥前状态，此时我们就需要再及时补充有益菌，此循环过程通常为一年，我们一年使用一次微生物菌肥即可。
使用微生物菌肥的注意事项
一、微生物菌肥和化肥农药混合使用时，要严格控制混合比例，以免造成对有益菌的破坏，影响其使用效果。
二、避免不同微生物菌肥的混合使用，防止出现不同生物菌之间的相互抗拮，不利于有益菌的存活和繁衍，从而影响其使用效果。
三、在使用微生物菌肥时，配合有机肥一同施用，效果会明显增加，有机肥的施用可以增加土壤有机质，从而为有益菌的生存和繁衍提供了载体，要注意有机肥一定要充分腐熟发酵。
微生物菌肥是非常好的肥料，也要在合适的时间，使用合适的用量，不要盲目使用，只有方法、时间、用量准确的情况下才会有效果。
微生物菌肥的作用
微生物菌肥顾名思义含有大量有益菌，主要补充土壤的有益菌，提高土壤的活性，增加土壤有机质，可以有效缓解土壤板结和酸碱度，起到改良土壤的作用，从而提高土壤养分的利用率，促进作物根系生长，增强养分的吸收能力，增强作物长势，从而使作物的抗逆性得以提高，对提高农作物的产量和品质效果显著。