那么鱼菜共生系统是如何构建呢?
原理其实很简单，就是鱼池养鱼，养的鱼可以包括观赏鱼、石斑鱼、鲈鱼、鲶鱼、鲤鱼、鲫鱼、甚至虾、龟等。用石头子，火山岩等基质作苗床种植各种蔬菜(瓜果，叶菜)等植物，用水泵抽送的饲养水流经种植床后返回到鱼池，循环往复，蔬菜可以从循环的饲养水中汲取大量的营养物质，同时，水在循环中也得到了矿质元素与固态物的吸收净化，待返回鱼池时，水质已得到了生物过滤与净化.对于养鱼来说苗床的作用就是一个天然的生物过滤作用.对于种植来说饲养水就是天然的营养液.如果同时混合栽种各种蔬菜，就可以起到防虫的效果，也就是把香菜、黄瓜、番茄、罗勒、甜菜、爬豆、万寿菊等进行科学的混栽，就能起到生物抑虫抑菌作用，与单一栽培青一色的品种，要效果更好。
也许你是才听到鱼菜共生，含有鱼粪等废物的养殖水被泵到长着植物的苗床上，供给植物根部吸收养分，当水回到鱼池的时候，它不但已经是得到净化，而且也充足了氧气，成为了名副其实的充满活力的活水．两者有机的组合成生态系统，节能以及高产的养殖栽培系统．不同的人可以从用不同的方法和途径来构造他们自己用途的系统，水族爱好者把它做成比较美观的系统，同时种植一些观赏植物和蔬菜，而有些人可能就倾向于建造一种可以提供新鲜安全的鱼和蔬菜等食物的系统。
鱼菜共生系统的构建不拘一格，形式多种多样，你即可以因陋就简，你也同样可以豪华，根据你场地的形状大小，你可以选择你所需要的，经济能够承受的装置，只要是能装水的东西你基本都可以使用，豪华的如水族箱，鱼池，简单的如废弃的水桶水盆，鱼菜共生基地，你同样可以选择用废弃的浴缸，水槽，PVC管，定制的玻璃纤维缸等等．系统的苗床并不只是一定只用到石头子，我们还可以简单地将植物穿过泡沫板，让泡沫板漂浮在水上，现行的NFT，气培等各种栽培技术都可以借助你的丰富的想象力，运用在这个系统上。
种养分离（松耦合）系统，通过将系统分隔为三个独立的板块进行运转，即养殖区，微生物处理区（矿化处理区），种植区。养殖产生的有机废弃物被单独分离，不参与系统循环，经发酵系统制成液态有机肥，再输入到栽培区，同时将外源基质肥作为二培基质，共同为蔬菜提供养料。而被过滤后的水体被生物滤池处理后再回到养殖区。系统运行中，以youzhi的条件来对三个板块进行独立操控，因此，对于系统水体理化指标，生物质因素的改变，则是采取分隔处理的原则，同时满足养殖鱼类，微生物以及植物对不同环境条件的需求。
而智能化鱼菜系统则是基于UVI模式系统或/和种养分离（松耦合）系统的基础再融入现代农业技术，通过增加设施设备投入来优化生产环境、控制系统各个板块的反应进程来建设系统和实现生产管理。
在鱼菜共生系统中，菜的种植就是采用就是水培、雾培以及基质培，在这里的基质培只能选用岩棉基质。对于水培与雾培来讲，它营养成分主要是来源养殖中鱼的粪便进行一系列的发酵，形成作物生长需要的肥料。这个与传统的无土栽培基本类似，经过植物吸收后，还会流入到养殖区域，不过经过种植设施的水需要经过过滤处理，才能再次流入到养殖区域中。
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